GigaPath-Flash y GigaTIME-Flash: Revolucionando la investigación patológica a gran escala

GigaPath-Flash and GigaTIME-Flash: Toward population-scale discovery with efficient pathology foundation models

Microsoft Research ha presentado dos nuevos modelos, GigaPath-Flash y GigaTIME-Flash, que prometen revolucionar la investigación patológica a gran escala al mejorar significativamente la eficiencia de los modelos base de patología. Estos modelos permiten a los investigadores analizar cohortes más grandes y realizar experimentos más extensos, acercándose al descubrimiento a escala poblacional.

La familia Flash extiende las capacidades de GigaPath y GigaTIME, modelos que ya habían demostrado cómo los modelos base pueden apoyar el análisis de diapositivas completas y la modelización del microambiente tumoral a partir de datos de patología recopilados rutinariamente. Sin embargo, GigaPath-Flash y GigaTIME-Flash hacen que estas capacidades sean sustancialmente más eficientes, permitiendo a los investigadores realizar más experimentos y avanzar hacia descubrimientos a escala poblacional.

La histopatología es una de las fuentes de información más ricas y ampliamente disponibles en la investigación del cáncer. Cada biopsia de tejido produce una imagen de diapositiva completa que captura la morfología celular a resolución subcelular, y los hospitales generan millones de estas diapositivas cada año. Estos datos contienen información relevante para el diagnóstico, pronóstico, selección de tratamientos y la biología del microambiente tumoral.

Los modelos base han comenzado a desbloquear esta información a gran escala. Sin embargo, las imágenes de diapositivas completas son grandes, a menudo superando un gigapíxel, y aplicar un modelo base a una sola diapositiva requiere procesar miles de mosaicos de imágenes. Cuando una pregunta de investigación involucra a decenas de miles de pacientes, el costo computacional crece rápidamente. Y el descubrimiento a escala poblacional no es una ejecución de modelo única: requiere ciclos repetidos de extracción de características, análisis estadístico, prueba de hipótesis y validación en subgrupos de pacientes, biomarcadores y puntos finales clínicos.

Para realizar el potencial completo de los modelos base de patología, se necesitan modelos que puedan aplicarse repetidamente y de manera asequible a grandes poblaciones de pacientes. La familia Flash, con su diseño eficiente, aborda esta necesidad crítica, permitiendo descubrimientos significativos en la investigación del cáncer.

Fuente: https://www.microsoft.com/en-us/research/blog/gigapath-flash-and-gigatime-flash-toward-population-scale-discovery-with-efficient-pathology-foundation-models/